Marmara Denizi'nde son zamanlarda artan müsilaj sorunu, çevre ve ekosistem üzerinde olumsuz etkiler yaratmaya devam ediyor. Deniz suyunun üstünde yoğun şekilde görülen müsilaj tabakaları, balık türlerinin yaşam alanlarını etkileyerek balık ölümlerine neden olabilmektedir. Ayrıca, deniz dibinde birikerek deniz canlılarının yaşamını güçleştiren ve deniz ekosisteminde dengesizliklere yol açan müsilaj, ağır metal ve zararlı kimyasalları da bünyesinde barındırarak deniz suyunun kirlenmesine sebep olmaktadır.
Müsilajın artış gösterdiği bölgelerde deniz turizmi de olumsuz etkilenmekte, plajların ve deniz aktivitelerinin kısıtlanmasına yol açmaktadır. Ayrıca, müsilajın kokusu ve görüntüsü, deniz kıyılarındaki yaşamı da olumsuz etkileyerek bölge halkının sağlığını da tehdit etmektedir.
Müsilaj sorununun çözümü için acil önlemler alınması gerekmekte olup, deniz temizliği konusunda çalışmalar yürütülerek deniz ekosistemi ve canlıların korunması için adımlar atılmalıdır. Ayrıca, endüstriyel atıkların denize dökülmesi gibi çevre kirliliğine sebep olan faktörlerin de kontrol altına alınması ve deniz temizliği için sürdürülebilir çözümler üretilmesi gerekmektedir.